Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myf5P24699 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myf5P24699 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Myf5P24699 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf5P24699 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf5P24699 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myf5P24699 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf5P24699 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms