Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsp1P19973 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms