Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RargP18911 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RargP18911 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RargP18911 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RargP18911 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RargP18911 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RargP18911 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RargP18911 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RargP18911 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RargP18911 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RargP18911 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RargP18911 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RargP18911 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RargP18911 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RargP18911 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RargP18911 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RargP18911 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RargP18911 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RargP18911 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RargP18911 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RargP18911 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RargP18911 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RargP18911 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RargP18911 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RargP18911 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RargP18911 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RargP18911 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RargP18911 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RargP18911 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RargP18911 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RargP18911 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RargP18911 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RargP18911 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RargP18911 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RargP18911 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RargP18911 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RargP18911 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RargP18911 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RargP18911 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RargP18911 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RargP18911 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RargP18911 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RargP18911 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RargP18911 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RargP18911 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RargP18911 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RargP18911 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RargP18911 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms