Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fgfr1P16092 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr1P16092 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms