Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkceP16054 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkceP16054 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkceP16054 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkceP16054 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkceP16054 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkceP16054 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PrkceP16054 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PrkceP16054 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms