Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme1P15532 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme1P15532 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms