Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms