Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtsbP10605 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtsbP10605 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsbP10605 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms