Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spta1P08032 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms