Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TnfP06804 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TnfP06804 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnfP06804 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TnfP06804 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TnfP06804 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TnfP06804 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TnfP06804 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TnfP06804 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TnfP06804 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TnfP06804 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnfP06804 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TnfP06804 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TnfP06804 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TnfP06804 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TnfP06804 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TnfP06804 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TnfP06804 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TnfP06804 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TnfP06804 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TnfP06804 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TnfP06804 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TnfP06804 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TnfP06804 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TnfP06804 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TnfP06804 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TnfP06804 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TnfP06804 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TnfP06804 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnfP06804 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnfP06804 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnfP06804 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnfP06804 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnfP06804 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnfP06804 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnfP06804 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnfP06804 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnfP06804 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnfP06804 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TnfP06804 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TnfP06804 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TnfP06804 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TnfP06804 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TnfP06804 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TnfP06804 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TnfP06804 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TnfP06804 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TnfP06804 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TnfP06804 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms