Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01660 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01660 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01660 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01660 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01660 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01660 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01660 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01660 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01660 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms