Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01658 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01658 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01658 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01658 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01658 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01658 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01658 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01658 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01658 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01658 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01658 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01658 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01658 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01658 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01658 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01658 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01658 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01658 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms