Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01655 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01655 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01655 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01655 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01655 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01655 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01655 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01655 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01655 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01655 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01655 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01655 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01655 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01655 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01655 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01655 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01655 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01655 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01655 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01655 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01655 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01655 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01655 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01655 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01655 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01655 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01655 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01655 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01655 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01655 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01655 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01655 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01655 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01655 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01655 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01655 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01655 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01655 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01655 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01655 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01655 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01655 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01655 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01655 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01655 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01655 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01655 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01655 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms