Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best1O88870 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best1O88870 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best1O88870 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best1O88870 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best1O88870 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best1O88870 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best1O88870 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Best1O88870 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Best1O88870 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Best1O88870 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Best1O88870 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best1O88870 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best1O88870 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best1O88870 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best1O88870 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best1O88870 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best1O88870 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best1O88870 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best1O88870 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Best1O88870 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best1O88870 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best1O88870 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best1O88870 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best1O88870 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best1O88870 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best1O88870 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best1O88870 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms