Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3fO88632 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms