Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm10509O88255 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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