Protein–RNA interactions for Protein: O88245

Gm10139, Mszf85 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10139O88245 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10139O88245 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm10139O88245 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm10139O88245 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10139O88245 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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