Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SfnO70456 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfnO70456 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfnO70456 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfnO70456 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SfnO70456 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SfnO70456 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SfnO70456 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SfnO70456 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SfnO70456 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SfnO70456 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SfnO70456 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SfnO70456 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SfnO70456 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SfnO70456 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SfnO70456 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SfnO70456 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SfnO70456 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SfnO70456 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SfnO70456 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SfnO70456 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SfnO70456 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SfnO70456 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SfnO70456 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SfnO70456 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SfnO70456 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SfnO70456 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SfnO70456 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SfnO70456 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SfnO70456 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SfnO70456 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SfnO70456 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SfnO70456 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SfnO70456 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SfnO70456 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SfnO70456 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SfnO70456 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SfnO70456 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SfnO70456 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SfnO70456 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms