Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtssO70370 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtssO70370 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtssO70370 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtssO70370 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtssO70370 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtssO70370 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtssO70370 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtssO70370 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtssO70370 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtssO70370 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtssO70370 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtssO70370 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtssO70370 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtssO70370 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtssO70370 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtssO70370 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtssO70370 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtssO70370 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtssO70370 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CtssO70370 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtssO70370 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtssO70370 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtssO70370 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtssO70370 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtssO70370 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtssO70370 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtssO70370 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtssO70370 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtssO70370 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtssO70370 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtssO70370 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtssO70370 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtssO70370 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CtssO70370 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtssO70370 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtssO70370 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtssO70370 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CtssO70370 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtssO70370 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtssO70370 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtssO70370 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtssO70370 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtssO70370 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms