Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms