Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TsksO54887 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TsksO54887 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TsksO54887 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TsksO54887 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TsksO54887 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TsksO54887 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TsksO54887 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TsksO54887 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TsksO54887 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TsksO54887 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TsksO54887 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TsksO54887 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TsksO54887 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TsksO54887 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TsksO54887 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TsksO54887 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TsksO54887 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TsksO54887 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TsksO54887 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TsksO54887 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TsksO54887 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TsksO54887 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TsksO54887 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TsksO54887 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TsksO54887 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TsksO54887 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TsksO54887 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TsksO54887 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TsksO54887 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TsksO54887 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TsksO54887 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TsksO54887 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TsksO54887 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TsksO54887 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TsksO54887 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TsksO54887 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TsksO54887 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TsksO54887 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TsksO54887 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TsksO54887 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TsksO54887 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TsksO54887 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TsksO54887 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TsksO54887 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TsksO54887 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TsksO54887 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TsksO54887 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TsksO54887 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms