Protein–RNA interactions for Protein: O35655

Ppef1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef1O35655 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef1O35655 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppef1O35655 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms