Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms