Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d1bO35324 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d1bO35324 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms