Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Polr1aO35134 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms