Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3aO08576 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms