Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm3488M0QW81 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3488M0QW81 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms