Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms