Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700067P10RikG3X8U2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.4 ms