Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms