Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ercc6F8VPZ5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms