Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc37F8VPK0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttc37F8VPK0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms