Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
D430041D05RikF6ZGR6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
D430041D05RikF6ZGR6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms