Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igkv1-99F6XWB2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms