Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85cE9Q6B2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85cE9Q6B2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms