Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r48E9Q5D8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms