Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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