Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8127E9Q0P0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8127E9Q0P0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8127E9Q0P0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms