Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ryr1E9PZQ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ryr1E9PZQ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms