Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms