Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sptbn4E9PX29 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms