Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifit3bE9PV48 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms