Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm8994E9PV04 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8994E9PV04 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms