Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930467E23RikD3Z1P8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930467E23RikD3Z1P8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms