Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc6D3YZP9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms