Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nxpe3B9EKK6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nxpe3B9EKK6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms