Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms