Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cspp1B2RX88 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cspp1B2RX88 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms