Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3lB2RV38 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms