Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r5B2RQT2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms